菊池重安の子として生まれ、延徳3年（1491年）に生を受ける。永正元年（1504年）、はとこの菊池能運の死去を受け、14歳で菊池氏の家督を継ぎ肥後守となる。しかし、若年であることを理由に肥後の国人衆が反発し、永正2年（1505年）に阿蘇氏や大友氏と共謀して政隆を廃立しようとする。永正4年（1507年）、居城を追われて逃亡し、相良氏を頼るも助力を得られず、最終的には筑後で再起を図る。永正6年（1509年）、大友氏の攻撃を受けて捕らえられるが、旧臣に助けられ久米安国寺に籠る。しかし、同年閏8月17日に久米原合戦で再び敗北し自害。享年19。法名は厳銷院天仙源祐居士。墓所は久米安国寺にある。