永禄元年（1558年）に生まれ、公卿として活躍。8歳で叙爵され、藤原北家閑院流の滋野井公古の猶子となるが、公古が亡くなり、滋野井家の家督を継承する。永禄12年に六位蔵人となり、禁色と昇殿を許される。同日、源元仲と名を改め、五辻家に戻り、滋野井家を中絶させる。その後、長男が滋野井家を再興。慶長5年に名を之仲に改め、慶長14年に従三位に叙され、公卿に列す。寛永3年に69歳で薨去。