江戸時代の武士であり、毛利氏の家臣として長州藩に仕えた。元禄8年（1695年）、父・小笠原長慶の死去に伴い、その家督を継承。享保5年（1720年）から享保11年（1726年）にかけて編纂された『萩藩閥閲録』において、先祖の加賀美遠光から自身までの系譜や関係書状をまとめ、「小笠原弥右衛門」として記録された。子の長昌が家督を継いだ。